Sequenciamento de dna pela plataforma 454

SEQUENCIAMENTO DE DNA PELA PLATAFORMA 454 As novas tecnologias de sequenciamento, denominadas de tecnologias de sequenciamento de nova geração, começaram a ser comercializadas em 2005. E estão evoluindo rapidamente. Todas essas tecnologias promovem o sequenciamento de DNA em plataformas capazes de gerar informação sobre milhões de pares de bases em uma única corrida. Dentre as novas plataformas de sequenciamento, duas já possuem ampla utilização em todo o mundo: a plataforma 454 FLX da Roche e a Solexa da Illumina.em síntese, o pirosequenciamento (RONAGHI et al., 1998). A leitura da sequência nesse sistema é realizada a partir de uma combinação de reações enzimáticas que se inicia com a liberação de um pirofosfato, oriundo da adição de umdesoxinucleotídeo à cadeia. Em seguida, esse pirofosfato é convertido para ATP, pela ATP sulfurilase, sendo este utilizado pela luciferase para oxidar a luciferina, produzindo um sinal de luz O sistema requer que o DNA seja mecanicamente fragmentado em sequências de 300 – 800pb, transformado em fragmentos abruptos fosforilados e ligado a adaptadores de sequência específica (Figura 1). A biblioteca de DNA da amostra é ligada a adaptadores A e B nas extremidades 3’ e 5’ dos fragmentos, respectivamente, os quais são utilizados nas etapas posteriores de isolamento dos fragmentos (A-B) e amplificação e nas reações de sequenciamento. O adaptador B possui biotina ligada à extremidade 5’, o que permite o isolamento dos…

Humana e Meio Ambiente NGS – Next Generation Sequencing (Sequenciamento de Nova Geração): Tecnologias e aplicações André Marques MSc. Biologia Vegetal – UFPE 24.02.2015 1 História e futuro do sequenciamento 1953 - Descoberta do DNA por Watson & Crick 2 História e futuro do sequenciamento 1953 - Descoberta do DNA por Watson & Crick 1973 - Primeira sequência de DNA publicada 3 História e futuro do sequenciamento 1953 - Descoberta do DNA por Watson & Crick 1973 - Primeira…

As novas tecnologias de sequenciamento,denominadas de tecnologias de sequenciamento de nova geração, começaram a ser comercializadas em 2005e estão evoluindo rapidamente. Todas essastecnologias promovem o sequenciamento de DNA em plataformas capazes de gerar informação sobre milhões de pares de bases em uma única corrida. Dentre as novas plataformas de sequenciamento, duas jápossuem ampla utilização em todo o mundo: a plataforma 454 FLX da Roche e a Solexa da Illumina. Outros dois…

projeto. Também agradeço a Nátalia, Roberto, Marcos e Georgios, que disponibilizaram um ambiente dentro do laboratório de bioinformática da Embrapa/Cenargen para que eu pudesse fazer alguns testes. Agradeço a todo apoio da minha família, que sempre me deram incentivo para concluir o projeto. E agradeço a Julia, que sempre esteve comigo, nunca deixou de me apoiar e de me ajudar, e me ajudou muito na elaboração e nas últimas correções deste texto. Por m, mas não menos importante, agradeço…

O Uso Rotineiro do Seqüenciamento do Genoma Microbiano inteiro em Diagnóstico Microbiologico na Saúde Pública Introdução Avanços na sequenciação do genoma inteiro (WGS) , resultaram numa redução no custo económico de sequenciação completa de um genoma bacteriano típico para tão pouco como 40 (a partir de DNA extraído a sequência do genoma). Além disso, a velocidade de sequenciação está a aumentar, com a perspectiva de, no futuro próximo de uma redução do tempo necessário para…

adjacentes à replicação de ambos os parasitas, morfologicamente, também idênticos. É relatada adiante a recorrênciar aos métodos sofisticados de modo a diferenciar as estirpes, sem abordagem da eletroforese do conteúdo proteico, que, contudo, também contribuiu para o efeito. P.salinus Vs P.dulcis No P. salinus, uma sequência de 2,2473,870 pb foi montada num único contig (um conjunto de fragmentos de DNA sobreponíveis, que juntos formam uma sequencia de consenso), sendo usada uma…

comparação das sequências entre dois genomas, o sequenciamento de genomas, entre outras. Além disso, o surgimento de novas tecnologias de sequenciamento de genomas tem substancialmente estendido a escala e resolução de muitas aplicações biológicas, assim como tem aumentado a produção de dados da ordem de giga bases (Gbp) por máquina ao dia [2]. Desta forma, essa grande quantidade de dados não somente precisam ser processados, mas também integrados e analisados em uma maneira mais…

durante este período. A todos vocês, nosso respeito e admiração. A todos aqueles que se envolveram direta ou indiretamente neste trabalho e aos nossos grandes amigos que sempre estiveram ao nosso lado nos momentos mais difíceis, nossos sinceros agradecimentos. iii Resumo SILVA, S. Camila; PINTO, O. Cássia. Desenvolvimento de uma ferramenta para análise de similaridade genética do complexo Leishmania donovani. 2012. 86p. Monografia (Trabalho de Conclusão de Curso). Instituto Federal…

45 5.2.2.3.1. Material genético ...........................................................................................................................45 5.2.2.3.2. Extração de RNA ...........................................................................................................................46 5.2.2.3.3. Obtenção de cDNA ........................................................................................................................46 5.2.2.3.4. Amplificação dos…

do processo A recuperação do produto OS BIOPROCESSOS NA INDÚSTRIA DE FERTILIZANTES AS FERRAMENTAS BÁSICAS CAPÍTULO 7. A CULTURA DE CÉLULAS E TECIDOS PÁGINA 69 O CULTIVO DE CÉLULAS E TECIDOS VEGETAIS As primeiras tentativas Os meios de cultura As etapas do processo As diferentes modalidades Melhoramento e conservação da biodiversidade vegetal A difusão da tecnologia A CULTURA DE CÉLULAS ANIMAIS A manipulação in vitro das células animais As aplicações da cultura…