NGS Next Generation Sequencing

à Saúde Humana e Meio Ambiente NGS – Next Generation Sequencing (Sequenciamento de Nova Geração): Tecnologias e aplicações André Marques MSc. Biologia Vegetal – UFPE 24.02.2015 1 História e futuro do sequenciamento 1953 - Descoberta do DNA por Watson & Crick 2 História e futuro do sequenciamento 1953 - Descoberta do DNA por Watson & Crick 1973 - Primeira sequência de DNA publicada 3 História e futuro do sequenciamento 1953 - Descoberta do DNA por Watson & Crick 1973 - Primeira sequência de DNA publicada 1977 - Publicação do método de sequenciamento Sanger 4 História e futuro do sequenciamento 1953 - Descoberta do DNA por Watson & Crick 1973 1977 1980 1982 1983 1987 - Primeira sequência de DNA publicada Publicação do método de sequenciamento Sanger Prêmio Nobel para Wally Gilbert e Fred Sanger Início do Genbank Desenvolvimento da PCR 1º sequenciador automático: Applied Biosystem Prism 373 5 História e futuro do sequenciamento 1953 - Descoberta do DNA por Watson & Crick 1973 1977 1980 1982 1983 1987 - Primeira sequência de DNA publicada Publicação do método de sequenciamento Sanger Prêmio Nobel para Wally Gilbert e Fred Sanger Início do Genbank Desenvolvimento da PCR 1º sequenciador automático: Applied Biosystem Prism 373 1996 1998 2000 2005 2006 2007 2009 2011 2011 2012 - Sequenciamento capilar: ABI 310 Genoma de C. elegans sequenciado Genoma humano sequenciado 1º Sistema de sequenciamento de nova geração 454 Life Sciences: GS 20 System 1º…

As novas tecnologias de sequenciamento,denominadas de tecnologias de sequenciamento de nova geração, começaram a ser comercializadas em 2005e estão evoluindo rapidamente. Todas essastecnologias promovem o sequenciamento de DNA em plataformas capazes de gerar informação sobre milhões de pares de bases em uma única corrida. Dentre as novas plataformas de sequenciamento, duas jápossuem ampla utilização em todo o mundo: a plataforma 454 FLX da Roche e a Solexa da Illumina. Outros dois…

SEQUENCIAMENTO DE DNA PELA PLATAFORMA 454 As novas tecnologias de sequenciamento, denominadas de tecnologias de sequenciamento de nova geração, começaram a ser comercializadas em 2005. E estão evoluindo rapidamente. Todas essas tecnologias promovem o sequenciamento de DNA em plataformas capazes de gerar informação sobre milhões de pares de bases em uma única corrida. Dentre as novas plataformas de sequenciamento, duas já possuem ampla utilização em todo o mundo: a plataforma 454…

comparação das sequências entre dois genomas, o sequenciamento de genomas, entre outras. Além disso, o surgimento de novas tecnologias de sequenciamento de genomas tem substancialmente estendido a escala e resolução de muitas aplicações biológicas, assim como tem aumentado a produção de dados da ordem de giga bases (Gbp) por máquina ao dia [2]. Desta forma, essa grande quantidade de dados não somente precisam ser processados, mas também integrados e analisados em uma maneira mais…

Imunologia e com ênfase em Imunologia Celular e Aplicada. Mestranda do Curso de Pós-graduação em Biologia Parasitária do Instituto Oswaldo Cruz - FIOCRUZ desenvolvendo a dissertação: “Caracterização do repertório da cadeia variável β do TCR e da apoptose em diferentes populações de Linfócitos T de pacientes com Leishmaniose Tegumentar Americana" no laboratório de Imunoparasitologia do Instituto Oswaldo Cruz/FIOCRUZ, sob orientação do Dro Álvaro Luiz Bertho dos Santos. Treinée na…

trata com um núm ero específico de símbolos e com as regras a eles relacionadas, para que a informação possa ser codificada. Portanto, sintaxe está relacionada com codificação (símbolos e regras utilizados para formatar informação). Existem muitos sistemas de códigos conhecidos: ®binário:___________ 2 símbolos ®decim al:__________ 10 símbolos alfabeto:___________26 letras • genético:__________ 4 letras químicas (ACTG) O sistema de código a ser adotado depende em muito da maneira como o…

com uma faca.4 O desejo manifestado por uma paciente de amputar o estômago tomado pelo câncer — “sem deixar nada”, como dizia — fazia lembrar William Halsted, cirurgião perfeccionista do século xix que desbastava o câncer com operações cada vez maiores e mais desfiguradoras, na esperança de que quanto mais cortasse maior seria a possibilidade de cura. Por baixo dessas interceptações médicas, culturais e metafóricas do câncer ao longo dos séculos desenvolvia-se a compreensão biológica da…

Laboratories – IUPAC Technical Report. Pure Appl Chem 2006;78(1)145-96. 152 7. Biologia molecular no laboratório de microbiologia Introdução Os cinco exames de biologia molecular de maior volume nos laboratórios clínicos são aqueles que detectam agentes de doenças infecciosas: HPV, Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, HIV, HCV e HBV. Em função da tendência de centralização de métodos na maioria dos laboratórios, esses testes usualmente são alocados em um setor exclusivo de…

Enrofloxacina, Danofloxaxina Lincosamidas1 Lincomicina, Clindamicina, Pirlimicina Macrolídeos1 Eritromicina, Tilmicosina, Tilosina, Tulatromicina Peptídeos2 Bacitracina Pleuromutilinas2 Tiamulina Polimixinas2 Colistina Sulfonamidas1 Sulfadimetoxina, Sulfas combinadas, Sulfas potencializadas Tetraciclinas1 Clortetraciclina, Oxitetraciclina 1Bactericida; 2Bacteriostático 11 TABELA 2 Mecanismo de Ação dos Antibióticos Classe Atividade Aminoclitóis, Aminoglicosídeos, Fenicóis,…

Enrofloxacina, Danofloxaxina Lincosamidas1 Lincomicina, Clindamicina, Pirlimicina Macrolídeos1 Eritromicina, Tilmicosina, Tilosina, Tulatromicina Peptídeos2 Bacitracina Pleuromutilinas2 Tiamulina Polimixinas2 Colistina Sulfonamidas1 Sulfadimetoxina, Sulfas combinadas, Sulfas potencializadas Tetraciclinas1 Clortetraciclina, Oxitetraciclina 1Bactericida; 2Bacteriostático 11 TABELA 2 Mecanismo de Ação dos Antibióticos Classe Atividade Aminoclitóis, Aminoglicosídeos, Fenicóis,…