trabalho de bioquímica

UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MARINGÁ
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA
CURSO: CIENCIAS BIOLÓGICAS
PROFESSOR:Silvio Claudio da Costa
ACADÊMICA:Telma Hosana de Deus Ra:86554
PÓLO: Diamante do Norte

Lista nº 1C de Exercícios de Bioquímica
1)Quais reagentes podem ser empregados para marcar a extremidade aminoterminal de uma cadeia polipeptídica?
1-fluoro-2,4 dinitrobenzeno,felinisotiocianato , cloreto de dansila ,cloreto de dabsila.
2)Quais são as etapas do processo conhecido como degradação de Edman?
Cada ciclo da reação compreende 3 etapas:
1)Reação da proteína com PITC, que se acopla ao grupo amino NH2- livre do aminoácido
2)Hidrólise ácida da proteína conjugada com PITC libera a feniltiohidantoína (PTH) do aminoácido 1 e o restante da proteína, tornando o aminoácido 2 o novo resíduo Nterminal
3)Análise cromatrográfica do PTH-aminoácido e novo ciclo de reação com o novo Nterminal da proteína.
Dessa forma ,resíduo a resíduo a degradação de Edmanpode elucidar a sequencia inteira de aminoácidos de um peptídeo.
3)Qual a limitação da degradação de Edman, e como a mesma pode ser contornada ?
Cada etapa do processo age com eficiencia menor que 100% deixando fragmentos de Nterminais variados,tornando impossível mais adiante a diferenciação entre os contaminantes e o aminoácido PTH correto para aquela posição no peptídeo. O comprimento de leitura para a degradação de Edman varia de 05 a 30 resíduos dependendo da quantidade e da pureza do peptídeo.
Quando uma proteína possui mais de 20-30 resíduos de aminoácidos, não é possível sequenciá-la diretamente pelo método de Edman.
Para obter a sequência completa de uma proteína, é necessário sequenciar vários peptídeos da mesma proteína, obtidos por diferentes tipos de quebra da cadeia, até haver sobreposição de suas sequências.
4)O que são proteínas homólogas?
São proteínas que desempenham a mesma função em tecidos ou espécies diferentes,possuem pequenas diferenças estruturais reconhecíveis imunológicamente