Mitocôndrias
Preenchendo espaços no interior das mitocôndrias, há uma substância semelhante ao hialoplasma, a matriz mitocondrial onde encontram-se dissolvidas moléculas de proteínas, açúcares, enzimas, ribossomos e os ácidos nucléicos, RNA e DNA mitocondrial, este último, exclusivamente de herança materna, isto é, somente a mãe contribui com o DNA mitocondrial, para todos os filhos, meninos e meninas. Isso ocorre porque as mitocôndrias paternas (do espermatozoide) são destruídas pouco tempo depois da fertilização.
O alto grau de independência das mitocôndrias e dos cloroplastos, pelo fato de possuírem as suas próprias moléculas de ácidos nucléicos (DNA e RNA), levou à elaboração da "hipótese endossimbiôntica": esses orgânulos teriam se originado de procariontes de vida livre, possivelmente bactérias que em algum momento associaram-se a uma célula de eucarionte.
Respiração celular aeróbia
Processo fornecedor de energia, a respiração celular aeróbia divide-se em três fases: glicólise, ciclo de Krebs e cadeia respiratória.
1. Glicólise
A glicólise ocorre no hialoplasma, ou seja, fora da mitocôndria, e tem o seu início a partir da molécula de glicose, sem a participação do oxigênio. No hialoplasma encontram-se uma série de enzimas responsáveis pelo processo.
No início do processo, a glicose precisa ser ativada e sofre uma transformação. Para que isso ocorra é necessário um consumo de energia de dois ATP. Em seguida, a molécula de glicose perde hidrogênios, que não podem ficar livres na célula para não deixar o pH celular ácido. Esses hidrogênios são, então, capturados por um aceptador intermediário chamado de NAD, que se liga aos hidrogênios e transforma-se em NADH ou NADH . As moléculas de glicose são finalmente quebradas em duas moléculas de piruvato ou ácido pirúvico e libera nessa quebra, energia suficiente