NGS Next Generation Sequencing

amplicons  Perfil de amplicon cancerígeno  ... 60 Sequenciamento de sequências de interesse 61 Aplicações • Sequenciamento de sequências transcritas  Sequenciamento do RNA total e RNAm  Sequenciamento do miRNA  Sequenciamento do exoma – doenças  ... • Sequenciamento de DNA por imunoprecipitação da cromatina (ChIP-seq) • Variações estruturais • Metagenômica 62 Aplicações Verificação de mutações em genes envolvidos em doenças • Sequenciamento de sequências transcritas  Sequenciamento do RNA total e RNAm  Sequenciamento do miRNA  Sequenciamento do exoma – doenças  ... Análise simultânea multigênica • Sequenciamento de DNA por imunoprecipitação da cromatina (ChIP-seq) • Variações estruturais • Metagenômica 63 Aplicações • Sequenciamento de sequências transcritas  Sequenciamento do RNA total e RNAm  Sequenciamento do miRNA  Sequenciamento do exoma – doenças  ... • Sequenciamento de DNA por imunoprecipitação da cromatina (ChIP-seq) • Variações estruturais • Metagenômica 64 Aplicações • Sequenciamento de sequências transcritas  Sequenciamento do RNA total e RNAm  Sequenciamento do miRNA  Sequenciamento do exoma – doenças  ... • Sequenciamento de DNA por imunoprecipitação da cromatina (ChIP-seq) • Variações estruturais • Metagenômica 65 Um nicho ecológico comunidade populações JCSetubal, 2012 JC Setubal 5 66 DNA A comunidade JCSetubal, 2012 67 JC Setubal 6 DNA A comunidade SEQ JCSetubal, 2012 JC Setubal BIOINFO 7 68…

com o tipo de infecção. No caso do teste de HIV, o período é normalmente de duas a doze semanas. Procedimentos como doação de sangue requerem medidas de prevenção a contaminações que possam vir a ser ocultadas devido à janela imunológica. Aplicação de anti-corpos Os anticorpos específicos podem ser usados para a detecção de proteínas e células específicas, sendo portanto, aplicados nas áreas de saúde e em pesquisas para o diagnóstico de doenças. Ex.: Detecção de tipos…

Rev. Pat. Trop. — (1): 4, 393-402, 1972 IMUNOLOGIA DA BLASTOMICOSE SUL AMERICANA — Resultados preliminares na imunoprecipitação. * WILLIAM BARBOSA *• JOANA ROSA MENDONÇA LOPES DE OLIVEIRA "** RESUMO Estudamos soros de 24 pacientes, bem documentados, de blastomicose sul americana. De l a 12 amostras do mesmo soro foram testadas contra antígeno, extraído da forma leveduriforme do P. brasiliensis, em concentrações que variaram de 50 a 200 mg/ml, pela técnica de imunodifusão…

produzido o primeiro anticorpo, sendo este anticorpo ligado a alguma molécula de detecção, como por exemplo a peroxidase ou moléculas fluorescentes. 2.3.2 Separação Para que se possa separar um antígeno do restante de componentes de um homogeneizado, é necessário que o anticorpo específico para este antígeno esteja ligado a algo facilmente separável. Geralmente liga-se o anticorpo a esferas de agarose que é um material inerte e pode ser utilizado tanto em colunas cromatográficas como…

IMUNOENSAIOS DE AGLUTINAÇÃO O fundamento básico é similar ao princípio das técnicas de precipitação, diferindo na adsorção do antígeno ou do anticorpo a micropartículas insolúveis ou células e permitindo leitura visual e rápida. Uma desvantagem em relação à imunoprecipitação, é que a técnica de aglutinação não permite discriminar frações dos componentes antigênicos, mas permite a utilização de antígenos purificados e complexos fixados a micropartículas ou células. Também pode ser…

Modificações Pós-Traducionais Pós- ? A complexidade das amostras com MPTs ? Características físico-químicas (MPTs lábeis) ? Tamanho de peptídeos com MPTs Diminuem a eficiência/acurácia de detecção por MS ? Baixa concentração de MPTs ? Para análise em “ escala proteômica”é necessário : - enriquecimento de amostras com MPTs - utilização de MS em combinação com outras técnicas (géis 2D) Só é possível detectar MPTs quando em abundância Grande quantidade de amostra é…

reagentes marcados, estes amplificam o sinal, aumentando a sensibilidade de detecção. Os marcadores comumente utilizados são os radioativos, enzimáticos, fluorescentes e quimioluminescentes. Precipitação As técnicas de imunoprecipitação são baseadas na quantificação de precipitados formados pela reação Ag-Ac. A quantidade de precipitados formados quando, a uma concentração constante de Acs se vai adicionando Ag é caracterizada por uma curva parabólica. Precipitados já…

hidroximetiladas em normais), e depois com bissulfito de sódio (para que as citosinas metiladas sejam convertidas em normais e as normais, em uracilas). Submete-se ambas as amostras a PCR e, posteriormente, realiza-se o sequenciamento. Após isso, poderemos observar que a primeira terá citosinas normais no lugar das metiladas e hidroximetiladas, pois o bissulfito não é capaz de distingui-las e a segunda terá timinas no lugar das hidroximetiladas. Por fim, compara-se as duas para poder…

Profa. Alessandra Pardini Disciplina: Imunologia Clínica INTRODUÇÃO - A validação dos imunoensaios é feita com base nos parâmetros de sensibilidade, especificidade, repetitividade, reprodutibilidade e estabilidade - Problemas no imunoensaio = nova amostra = problema desaparece - Os imunoensaios são objeto de padronização e normatização - Controle de Qualidade – pré analítico PREPARO E INSTRUÇÕES AO PACIENTE FATORES INERENTES AO PACIENTE:  Idade  Sexo  Etnia …

organismo hospedeiro, esclarecendo a atuação de algumas das principais moléculas envolvidas nestes processos. 3.2 – Objetivos Específicos Sob uma análise comparativa, objetiva-se especificamente investigar a expressão de CD44 de superfície celular, já que esta molécula está presente na maioria dos tipos celulares humanos e, portanto, permite a obtenção de um parâmetro de expressão em células infectadas e não infectadas com o T. gondii. Com finalidade semelhante, visa-se…