Trabalho Microarray
Microarray ou Micro Arranjos de DNA,é uma técnica utilizada por cientistas pós Projeto Genoma que permite os estudos em grande escala dos genes das células e tecidos de interesse. A análise envolve romper uma célula, isolando seus conteúdos genéticos, identificando todos os genes que são ativados na célula particular e gerar uma lista desses genes. São conhecidos com “chips de DNA”que têm comoprincípio subjacente a comparação de amostras. Por exemplo, no processo de envelhecimento comparam-se tecidos jovens com tecidos envelhecidos observando suas evoluções, em situações de patologias, sãos comparados genes de tecidos patológicos com genes de tecidos não patológicos, observando assim as modificações e semelhanças nas expressões gênicas dos mesmos. A técnica de micro arranjos de DNA tem como vantagens a simplicidade do processo e a investigação de milhares de genes simultaneamente, em contra partida tem como desvantagens a utilização de ferramentas de bioinformática e análises estatísticas específicas, além de ser uma metodologia cara.
Executando a técnica
Exemplificando o funcionamento da técnica, será abordado seu uso em experimentos de expressão gênica. Primeiramente, é feita a extração do mRNA, são utilizados materiais genéticos de duas situações distintas, onde uma será a amostra controle e a outra a amostra experimento. No momento de coletar a amostra de células para a extração do mRNA, as mesmas devem ser imediatamente colocadas em temperaturas de congelamento, para evitar que enzimas RNAses degradem parcialmente o RNA, comprometendo seriamente a confiabilidade dos resultados. Após a extração do mRNA conforme protocolo específico para cada caso, é realizada uma RT-PCR(a técnica de RT-PCR é utilizada para amplificar segmentos de DNA), obtendo como produto final de interesse o cDNA. As amostras de cDNA são coradas com compostos fluorescentes, geralmente as cianinas Cy3 e Cy5, sendo que uma amostra é corada com Cy3 e a outra com Cy5. Este cDNA corado