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Sistemas funcionais compõem-se de diversos tipos de sistemas de informação que dão suporte às funções organizacionais de: contabilidade, finanças, marketing, administração do planejamento e produção, administração de recursos humanos.
As organizações vêem os sistemas de informação interfuncionais como uma forma estratégica de compartilhar recursos de informação e melhorar a eficiência e a eficácia de uma empresa, ajudando-a, assim, a atingir seus objetivos estratégicos.
A função organizacional de marketing diz respeito ao planejamento, promoção e venda de produtos em mercados existentes e ao desenvolvimento de novos produtos e novos mercados para melhor atender a clientes atuais e potenciais. Os Sistemas de Informação de Marketing integram o fluxo de informação necessário em muitas atividades de marketing, como web sites e serviços de internet/intranet possibilitando um processo de marketing interativo no qual os clientes possam tornar-se parceiros na criação, comercialização, compra e melhoria de produtos e serviços, sistemas de automação da força de vendas com tecnologias móveis de computação e internet para automatizar muitas atividades de processamento de informações para apoio e administração de vendas que fazem com que a produtividade pessoal dos vendedores aumente, a captação e a análise de dados de venda sejam agilizadas e outros sistemas de marketing que auxiliam os gerentes no planejamento, nas decisões e nas estratégias de promoção de venda e propaganda.
Os sistemas de informação de manufatura apóiam a função de produção /operações, a qual inclui todas as atividades relativas ao planejamento e controle dos processos de produção de bens ou serviços. A função de produção /operações diz respeito à administração dos sistemas operacionais de todas as empresas. Os sistemas de informação utilizados para a administração de operações e processamento de transações apóiam todas as empresas que precisam planejar, monitorar e controlar estoques, compras e o