Tecnicas moleculares utilizadas no diagnótico
INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA
Prof. Dr. Francisco Prosdocimi
2007
ÍNDICE
CAPÍTULO 1 UMA VISÃO GLOBAL DA BIOINFORMÁTICA 1.1. O que é a bioinformática? 1.2. O surgimento da bioinformática 1.3. O que preciso saber para ser um bom bioinformata? 1.4. Cursos de pós-graduação em bioinformática no Brasil 1.5. Conversando sobre bioinformática – BIOCHAT 1.6. Referências Bibliográficas e textos complementares 1.7. bRAINsTORM GENOMA, BIOLOGIA MOLECULAR E COMPUTAÇÃO 2.1. Introdução 2.2. Sequenciamento do DNA 2.3. Genômica 2.4. As ômicas: integrando a bioinformação 2.5. O PERL e outras linguagens de programação 2.6. Referências Bibliográficas e textos complementares 2.7. bRAINsTORM ALINHAMENTO DE SEQÜÊNCIAS 3.1. Introdução 3.2. Alinhamento Global 3.3. Alinhamento Local 3.4. Alinhamentos ótimos e heurísticos 3.5. Alinhamentos simples e múltiplos 3.6. Matrizes de comparação 3.7. Exemplos reais de alinhamentos 3.8. Referências Bibliográficas 3.9. bRAINsTORM MONTANDO UM GENOMA 4.1. Sobre genomas eucarióticos e procarióticos 4.2. Base-calling 4.3. Cross-match 4.4. Agrupamento de seqüências 4.5. Sobre a cobertura dos genomas 4.6. Referências Bibliográficas 4.7. bRAINsTORM ANÁLISE DE TRANSCRIPTOMAS 5.1. As ESTs 5.2. Histórico das ESTs 5.3. Agrupamento de ESTs 5.4. O genoma e o transcriptoma 5.5. SAGE – Serial Analysis of Gene Expression 5.6. Microarrays 5.7. Referências Bibliográficas 5.8. bRAINsTORM BANCOS DE DADOS EM BIOLOGIA MOLECULAR 6.1. Histórico 6.2. Bancos primários e secundários 6.3. GenBank e GenPept 6.4. RefSeq – O banco de dados de seqüências de referência 6.5. SWISSPROT – O maior banco de dados secundário de seqüências de proteínas 6.6. Gene Ontology – Sistema de classificação de genes de acordo com suas características 6.7. Referências Bibliográficas 6.8. bRAINsTORM ANOTAÇÃO DE GENOMAS 7.1. Introdução 7.2. Anotação de Nucleotídeos 7.3. Anotação de Proteínas 7.4. Anotação de Processos 7.5. A realização da Anotação Genômica (Sociologia da Anotação) 7.6.