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PLANEJAMENTO RACIONAL DE NOVOS ANTIMICROBIANOS: EXPLORANDO A ESTRUTURA DA MURF.
EDJAN CARLOS DANTAS DA SILVA¹; DICKSON NÓBREGA TRIGUEIRO DE MEDEIROS¹. EUZEBIO G. BARBOSA1
1Universidade Federal do Rio Grande do Norte. Departamento de Farmácia.

Introdução: A resistência à antimicrobianos é um grave fenômeno evolutivo que pode acarretar consequências desastrosas ao combate de infecções bacterianas. Há uma grande necessidade de se encontrar novos alvos biomacromoleculares para tratamento de doenças infecciosas. O sequenciamento de genomas levou a descoberta da proteína MurF e seus inibidores. A MurF é um produto essencial do gene do S. pneumoniae. Tal enzima utiliza ATP para catalisar a ligação do dipeptídeo D-ala-D-ala com o tripeptídeo UDP-MurAAc. Objetivos: Objetiva-se a criação de um banco de dados de inibidores de MurF retirados da literatura mais atual. Tal banco de dados será utilizado para a construção de modelos de interação fármaco-MurF para a compreensão da interação e planejamento racional de novos ligantes. Métodos: Foi feito um levantamento de diversos inibidores da MurF que compuseram um banco de dados. As estruturas foram desenhadas com softwares de modelagem molecular e realizada a ancoragem virtual (docking) dos mesmos no sítio de ligação da estrutura cristalográfica 2AM2 do banco de dados de proteínas (PDB). Resultados: Foram obtidas estruturas dos ligantes nos estados de protonação adequados por meio de servidores específicos. Após ter sido realizada a ancoragem virtual, todas as estruturas dos complexos foram verificadas manualmente para evitar inconsistências no modo de interação. Os complexos mais razoáveis do ponto de vista mecanístico foram analisados para evidenciar as interações intermoleculares mais importantes. Foi possível alinhar as conformações obtidas que serão utilizadas para a proposição de um farmacóforo e de modelos de QSAR-3D utilizando o LQTA-QSAR Conclusões: As conformações obtidas já evidenciaram possíveis pontos