Bióloga

RELATÓRIO DE AULA PRÁTICA
GENBANK

SÃO PAULO
2013
INTRODUÇÃO

Todas as atividades de um organismo são controladas pela regulação da expressão dos genes. A identificação dos genes expressos pode auxiliar na compreensão do metabolismo, por exemplo. Entre as técnicas moleculares para identificação de genes encontra-se a que utiliza cDNA, que possibilita uma rápida determinação do gene.
A síntese de cDNA é feita pela enzima transcriptase reversa, de origem viral, que produz uma molécula de DNA dupla fita, a partir da cópia de uma molécula de mRNA. Uma biblioteca de cDNA pode ser utilizada para clonar um gene de interesse, pois o isolamento do gene é significativamente mais simples do que em bibliotecas genômicas. Também é possível deduzir a sequência dos aminoácidos que comporão a proteína.
Em 1988 o governo americano lançou o primeiro banco de dados público contendo sequências de DNA, que recebeu o nome de Centro Nacional para Informação em Biotecnologia (NCBI), e hoje possui divisões no mundo inteiro, proporcionando banco de dados e ferramentas de bioinformática. O depósito e análise de sequências no banco de dados possibilita a manipulação e apreciação destas, utilizando softwares especiais.
Os bancos de dados públicos possibilitam o acesso à informação procedente de locais distintos, bem como troca e compartilhamento de sequências genéticas. O banco do NCBI é denominado GenBank.
Dentro do NCBI, é possível realizar a pesquisa BLAST (Basic Local Alignment Search Tool). Trata-se de um algoritmo que compara informações de sequências biológicas primárias, como sequência de aminoácidos de uma proteína, ou sequência de nucleotídeos de DNA. A pesquisa Blast permite a comparação da sequência fornecida na consulta, com a base dados, identificando as bibliotecas de sequências que se assemelham à consultada, exibindo o grau de semelhança.
A comparação de sequências é necessária para encontrar similaridades entre elas, possibilitando a construção de