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Determinação computacional dos efeitos da mutagénese em interfaces proteína-DNA
DEPARTAMENTO DE QUÍMICA E BIOQUÍMICA
FACULDADE DE CIÊNCIAS DA UNIVERSIDADE DO PORTO
SETEMBRO/2012
Rui Miguel Castro Ramos
Determinação computacional dos efeitos da mutagénese em interfaces proteína-DNA
Tese submetida à Faculdade de Ciências da Universidade do Porto para a obtenção do grau de Mestre em Química
Composição do Júri:
Professor Doutor Alexandre Lopes Magalhães
Professor Doutor José Ferreira Gomes
Professora Doutora Maria João Ramos
Doutor Sérgio Filipe Sousa
DEPARTAMENTO DE QUÍMICA E BIOQUÍMICA
FACULDADE DE CIÊNCIAS DA UNIVERSIDADE DO PORTO
SETEMBRO/2012
IV
Agradecimentos
À Professora Doutora Maria João Ramos e ao Professor Doutor Pedro Alexandrino Fernandes pela possibilidade que me deram de trabalhar no grupo, de descobrir e fomentar o gosto por esta área da Química e pelos ensinamentos prestados no decorrer deste trabalho.
À Doutora Irina Sousa Moreira que me acolheu desde o primeiro dia e me ensinou grande parte do que hoje sei sobre Química Teórica. Por ter estado sempre disponível quando precisava, pelo apoio, ajuda e motivação que me deu.
A todos os meus colegas do grupo pela simpatia e amizade com que me acolheram. Em particular a todos aqueles que estiveram no laboratório 3.26, à Elizabeth, à Bruna, à Ana, ao
Marco e César pelos bons momentos que ali passamos todos os dias.
Aos meus amigos, por estarem sempre presentes e me aturarem nos dias em que as coisas corriam menos bem. Particularmente ao João, com o qual passei grande parte dos meus dias nos últimos anos.
Á minha família, por tudo o que sempre me proporcionaram e por toda a motivação que me deram para atingir os meus objetivos. Sem eles nada teria sido possível.
Finalmente, à Elsa. Por ter estado sempre presente, nos bons e nos momentos menos bons, por todo o apoio e compreensão e por aquilo que significa para mim.
V
VI
Resumo
A descrição das propriedades