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Dentro da memória ROM há três programas distintos armazenados: BIOS que é responsável por "ensinar" ao processador da máquina a operar com dispositivos básicos, como o disco rígido; o POST que é o programa responsável pelo autoteste que é executado toda vez que ligamos a máquina; e o SETUP que é o programa responsável por alterar os parâmetros armazenados na memória de configuração (CMOS).
Normalmente para chamarmos o programa SETUP pressionamos a tecla Del durante a contagem de memória, assim que ligamos o computador e o processo de inicialização começa. Os fabricantes de placa mãe em geral, utilizam memórias ROM produzidas por outros fabricantes, dessa forma o programa de setup pode variar conforme seu fabricante.
A configuração do micro é armazenada dentro de uma memória chamada memória de configuração ou memória CMOS (Complementary Metal Oxide Semiconductor). As informações da identificação e localização dos componentes de hardware ficam gravadas nessa memória, que é uma memória do tipo RAM embutida no chipset ponte sul. Por essa razão é necessária uma bateria para alimentar a memória CMOS, assim quando o micro é desligado o conteúdo dela não será apagado como acontece com os módulos de memória RAM.
Dessa forma, quando chamamos o setup não "entramos" no BIOS nem muito menos alteramos os valores do programa BIOS, como muitas pessoas dizem erroneamente. Na verdade entramos no programa SETUP e alteramos os valores gravados da memória de configuração ou memória CMOS, localizada no chipset ponte sul.
Usuários que não conhecem as opções do programa SETUP e configurar erradamente os componentes de hardware podem causar erros de inicialização da máquina. Um recurso muito utilizado pelos usuários mais experientes e técnicos é zerar a memória CMOS, chamado comumente de ClearCMOS, que consiste em retirar a bateria que alimenta a memória durante alguns segundos e recoloca-la. Dessa forma o programa SETUP,