Modelagem Molecular

Carlos Rangel Rodrigues
A modelagem molecular é uma ferramenta importante no desenvolvimento de fármacos. Neste trabalho, descrevemos os dois principais métodos empregados na elaboração de programas de modelagem molecular: métodos de mecânica molecular e métodos semi-empíricos. A enzima HIV protease (HIVPR) foi selecionada como alvo terapêutico para mostrar como a modelagem molecular pode ser utilizada no planejamento racional de novos inibidores de HIVPR modelagem molecular, mecânica molecular, semi-empírico, HIVPR

influenciar na interação com o receptor. Como exemplos, podemos citar o m dos mais importantes avanços mapa de potencial eletrostático, o conno planejamento e descoberta torno da densidade eletrônica e a de novos fármacos tem sido a energia e os coeficientes dos orbitais utilização da modelagem molecular. de fronteira HOMO (Highest Occupied
Ela tem se firmado como uma ferraMolecular Orbital) e do LUMO (Lowest menta indispensável não somente no
Unoccupied Molecular Orbital) etc. processo de descoberta de novos fárOutras informações importantes tammacos, mas também na otimização de bém podem ser obtidas a partir da um protótipo já existente ou comparação obtido pelo próprio estudo estrutural entre
A maioria dos programas de modelagem molecular. diferentes mode modelagem molecular é
O grande desenvolviléculas, o que capaz de desenhar a mento da modelagem molepode permitir a estrutura molecular e cular deveu-se em grande geração de um realizar os cálculos de parte ao avanço dos recuríndice de similaotimização geométrica e sos computacionais em terridade que poestudos de análise mos de hardware (velocidade ser correlaconformacional de de cálculo) e software cionado com a
(programas de modelagem atividade farmacológica. A modelagem molecular). No passado, a utilização molecular também permite a visualizadesta técnica era restrita a um seleto ção tridimensional (3D) do complexo grupo de pessoas que desenvolviam