modelagem molecular

comparativa dos índices de similaridade molecular (CoMSIA, do inglês, comparative molecular similarity indices analysis), que se baseiam na premissa de que a atividade biológica está diretamente relacionada com as interações do tipo fármaco-receptor, ou seja, as moléculas bioativas geralmente produzem seus efeitos através de interações (e.g., de natureza não-covalente) estereoquímicas, eletrostáticas, hidrofóbicas e ligação de hidrogênio com o alvo macromolecular. Como essas interações apresentam caráter tridimensional, estes métodos consideram as moléculas em três dimensões, utilizando campos moleculares de interação (MIFs, do inglês, molecular interaction fields) como descritores moleculares.
MODELAGEM MOLECULAR E O PLANEJAMENTO DE INIBIDORES DE PROTEÍNAS qUINASES As proteínas quinases são conhecidas por regular a grande maioria das vias celulares. O genoma humano contém, aproximadamente, 500 genes para proteínas quinases, os quais representam aproximadamente 2% de todos os genes de eucariotos.70 A família das proteínas quinases compreende duas grandes subfamílias: (i) proteínas tirosina quinases e (ii) proteínas serina– treonina quinases. Dentre os membros da subfamília de proteínas serina–treonina quinases, encontram- se as Aurora quinases.71 Os mamíferos expressam três tipos de Aurora quinases: A, B e C, cujas funções biológicas estão relacionadas à regulação da mitose. A expressão e atividade quinase das proteínas Aurora A e B são determinadas pelo ciclo celular, de forma que somente durante a mitose estas proteínas são expressas e apresentam atividade biológica.72 A amplificação e super expressão do gene Aurora A foi observada em diversas linhagens de células tumorais (e.g., mama, ovários, cólon, próstata, neuroblastoma e cervical), sugerindo que a proteína Aurora A estaria relacionada à transformação oncogênica.73 Estes resultados levaram a formulação da hipótese de que a inibição da atividade quinase das enzimas Aurora A e B pudesse ser útil no