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1) Quais tipos de ligações ou forças estabilizam a estrutura primária, secundária, terciária e quaternária das proteínas?
2) Cite duas diferenças entre as formas de α-hélice e folha ß pregueada da estrutura secundária das proteínas.
3) As histonas são proteínas encontradas no núcleo das células eucarióticas, fortemente ligadas ao DNA. O Ponto Isoelétrico (pI) das histonas é 10,8. Que grupo de aminoácidos deve estar presente em número relativamente alto nas histonas? De que maneira esses aminoácidos contribuem para a forte ligação das histonas ao DNA?
4) Entre os aminoácidos, qual não é tecnicamente um aminoácido? Por quê? Qual aminoácido não contém átomos de carbono quiral?
5) Por que consideramos a ligação peptídica como sendo uma ligação covalente com caráter parcial de ligação dupla? Esquematize as estruturas de ressonância para o uma unidade peptídica.
6) Sugira uma razão pela qual as proteínas e os aminoácidos são normalmente mais solúveis em pH extremos do que em pH neutro.
7) Observe o esquema do aminoácido Lisina:
a) Esboce uma curva de titulação deste aminoácido considerando os seguintes pKs: pK1(-COOH)= 2,18; pK2(-NH3+)= 8,95; pKr=10,53.
b) Calcule o PI (ponto isoelétrico) desse aminoácido.
10) Faça uma distinção entre os modelos chave-fechadura e encaixe induzido para a ligação do substrato a uma enzima.
11) Para uma enzima que manifesta uma cinética de Michaelis-Menten, qual é a velocidade da reação, V0 (em percentagem de Vmax), observada em:
a) [S]=Km b) [S]=0,5Km c)[S]=0,1Km d) [S]=2Km
12) Orlistat, comercializado como Xenical™, inibe a lípase digestiva, diminuindo a absorção de lipídios, sem afetar a digestão de proteínas e carboidratos. Que hipótese poderia explicar a ação diferencial do fármaco?
13) Anidrase carbônica é