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Windows XP
Windows 7
Mac OS X
Linux
Interface
A mais conhecida pelos usuários, fácil de usar porque todo mundo já está acostumado.
Nova interface, mais bonita e fácil de usar.
Considerada a melhor interface, por causa da obcessão da Apple com design e usabilidade.
Depende da distribuição, há desde interfaces que imitam Windows até as sem interface gráfica.
Segurança
É o sistema mais sujeito a vírus e falhas, devido a sua popularidade. É praticamente obrigatório o uso de anti-vírus.
É bem mais seguro que as versões anteriores, e apresenta muito menos falhas.
Pouquíssimos vírus são conhecidos, e há poucas falhas de sistema.
Assim como o Mac OS X, é pouco conhecido e menos explorado por hackers, sendo considerado seguro.
Compatibilidade de software
Compatível com a maioria dos programas comerciais, exceto as versões novas, que já são feitas para Windows Vista ou 7.
É o sistema com mais programas compatíveis. Raramente você encontrará algo incompatível com Windows.
Possui muitíssimos programas compatíveis, inclusive o Office da Microsoft, mas às vezes terá que usar um emulador de Windows para rodar algum programa específico.
Muitos programas comerciais não são compatíveis com Linux, apesar de haver versões livres, inclusive para realizar funções como as do Adobe Photoshop.
Custo / Desempenho
Não é o sistema operacional mais rápido, mas pode funcionar em computadores mais antigos.
Se você precisa usar Windows e pode ter uma máquina topo de linha, é a escolha ideal.
São máquinas sempre mais caras, comparáveis aos topos de linha para Windows. O desempenho, no entanto, é considerado muito bom.
Apesar de não ter tanto suporte a novos hardwares, a flexibilidade e a capacidade de funcionar em qualquer computador fazem o Linux valer a pena.

Windows é Software Proprietário (o uso é restrito à licença)
Linux é Sofware Livre (você pode compartilhar à vontade)

Windows tem uma opção: Windows
Linux tem mais de Distros ou pacotes de