Extra O DNA E Eletroforese
Eletroforese
Extração de ácidos nucléicos
Requerimento essencial:
• quantidade
• pureza
• integridade
Etapas na obtenção de ácidos nucléicos:
• Lise física ou bioquímica das paredes celulares e membranas • Purificação dos ácidos nucléicos: desnaturação / inativação de proteínas celulares
• Precipitação
Extração de ácidos nucléicos
1. Rompendo
membranas celulares
Lise das células liberação dos componentes citoplasmáticos e/ou nucleares
- bactérias (parede glicoproteica) tratamento inicial com lisozimas (orifícios na parede enfraquecimento
rompimento em solução hipotônica); outras soluções alternativas: temperatura elevada; sonificação Extração de ácidos nucléicos
Células de plantas ou animais presentes em tecidos:
•
•
Pré tratamentos adicionais para romper a matriz tecidual célula individual lise: digestão enzimática / homogeneização
Célula vegetal – parede celular: tratamento mecânico para promover lise.
Extração de ácidos nucléicos
Células sem cobertura externa ou em solução:
Sem tratamentos agressivos – tratamento com detergente SDS
(SODIUM DODECYL SULFATE) – dodecil sulfato de sódio substâncias tenso ativas que agem dissociando as proteínas dos ácidos nucleicos e dissolvendo proteínas de membranas solução de lise: NH4Cl / NH4HCO3
2. Desnaturando proteínas celulares:
Lisados celulares contêm mistura complexa de macromoléculas:
- DNA / RNA; proteínas, lipídeos, carboidratos.
Fragmentos de membrana lipídica
Proteínas intracelulares: enzimas nucleases degradativas –
DNAses / RNAses interferem no rendimento dos ácidos nucléicos Melhora na recuperação dos ácidos nucléicos:
Extração em baixas temperaturas
Incubação dos lisados com reagentes desnaturan- tes de proteínas Extração de ácidos nucléicos
Agentes que retardam atividade das nucleases: tampões de extração com agentes quelantes (EDTA
– ácido etileno diaminotetracético)
- Solução de fenol/clorofórmio/álcool isoamílico desnaturam nucleases e coagulam