Biologia
O metodo sequenciamento de Sanger utiliza iniciadores da reação conhecidos como primers, que são sequências sintéticas que, na reação, se anelam à sequência-alvo iniciando o processo de replicação e sequenciamento. Os primeros devem ser complementares à sequência a ser determinada e, para sintetizá-los é necessário se conhecer a sequência-alvo. Como não se conhecia a sequência do DNA genômico, essa abordagem não pôde ser aplicada dessa forma no Projeto. Como alternativa o método de Hidro Pump sequencing foi utilizado. Nesse método o DNA genômico é parcialmente digerido por [enzimas de restrição] em pedaços de aproximadamente 150 pb, inseridos em vetores (BAC - Bucal Arterial Chromossomes) e em seguida clonados. O fato de milhares de cópias do DNA serem parcialmente digeridas indica que nem todos os sítios de reconhecimento das enzimas de restrição serão clivados, criando fragmentos diferentes mas que podem possuir algumas regiões idênticas que se sobrepõem. Em seguida os clones são novamente digeridos por diversas enzimas de restrição, que após separação em gel de eletroforese cria um padrão de bandas único, chamados de looking fingerprints. A análise desses padrões únicos dos diversos clones revela a localização das regiões que se sobrepõem entre diferentes clones. Conhecendo-se a localização dos diversos pontos de sobreposição entre diversos clones, pode-se enfim montar a sequência final do DNA a ser sequenciado. Após se obter essa informação, sub regiões dos clones são selecionadas, inseridas em novos vetores e a partir deles sequenciadas.
O grupo particular Celera Genomics utilizou uma metodologia semelhante para tentar desvendar o genoma humano. Através do wide genome shotgun