bioinformatica

01-defina alinhamento de sequencias e para que serve?
É um processo p comparar duas ou mais sequencias a fim de observar o que se tem em semelhante.serve p ver as parte s em comum
02-diferencie alinhamento global de alinhamento local:
Global: sequencias alinhadas de ponta a ponta
Local:são pedaços de sequencias q são comparados
03-quando um alinhamento é considerado ótimo?
Quando o alinhamento proposto teve um resultado preciso
04-o q é e no q se baseiam os alinhamentos heurísticos?
É o resultado mais próximo do resultado ótimo mas principal- mente produz um resultado veloz.
05-cite quais são os principais programas de alinhamento e defina suas características quanto ao tipo de alinhamento
,precisão e numero de sequencias alinhadas
Programa
Tipo de alinhamento
BLAST 2 SEQUENCES
LOCAL
SWAT
LOCAL
CLUSTAL W
GLOBAL
MULTALIN
GLOBAL
NEEDLEMAN WUNSCH
GLOBAL

Precisão do alinhamento
Numero de sequencias
HEURISTICO
2
OTIMO
2
HEURISTICO
N
HEURISTICO
N
OTIMO
2

06-Quando um alinhamento e considerado múltiplo?simples?
S-aquele realizado entre sequencias de DNA desde q 2 a 2
M-aquele realizado entre mais de 2 sequencias de DNA ou proteína.
07-O que são matrizes de comparação e em q casos são utilizados?
Utilizadas no alinhamento de sequencias proteicas
As matrizes servem p dar valores a diferentes nucleotídeos ou aminoácidos
08-em relação a montagem de genomas porque dizemos q p organismos procariontes o trabalho e muito mais simples do que p eucariontes?Isso se deve a varias características frequentement e comuns aos genomas,estes são pequenos, apresentam varias bases circulantes e contem poucas sequencias repetitivas ao contrario dos eucariontes
09-em que consiste e p q é utilizada a técnica de sequenciamento shotgun ou whole genome shotgun?
Serve p obter sequencias de genomas eucariontes e procariontes
.o DNA é quebrado em pedacinhos q são ligados a vetores de clonagem assim são sequenciados apartir de suas extremidades p q o genoma seja montado por completo.