Aminoacidos

Estrutura Primária de Proteínas
Uma proteína consiste numa (ou várias) cadeias longas obtidas por reacção de condensação de aminoácidos (cadeia peptídica). A sua estrutura primária consiste na sequência dos aminoácidos constituintes. As estruturas secundária,terciária e quaternária de uma proteína, de que falaremos em seguida, são determinadas pela sua estrutura primária, pelo que é fundamental avaliar como a natureza dos aminoácidos e as características da ligação peptídica determinam a estrutura tridimensional de uma proteína.
Aminoácidos
| Estrutura | Propriedades | Ligação Peptídica | Ângulos de Diedro |
Estrutura
Os aminoácidos apresentam uma estrutura geral que consiste num grupo amino, um grupo carboxílico e uma cadeia lateral R, de dimensão e características variáveis, ligados a um carbono saturado (Cα). Podem ser encontrados 20 diferentes aminoácidos em proteínas.

O aminoácido mais simples é a glicina em que R= H pelo que a glicina é o único aminoácido opticamente inactivo. Os restantes aminoácidos apresentam estereoisómeros verificando-se que é incorporado em proteínas o isómero levógiro (L). Dependendo do grupo funcional, as cadeias laterais podem ser alifáticas, aromáticas, ácidas (carga negativa) , básicas (carga positiva) ou polares. A prolina é um aminoácido especial em que a cadeia lateral está ligada ao azoto da cadeia principal.

Propriedades
A estrutura tridimensional de uma proteína é determinada pela sequência dos aminoácidos constituintes, mais concretamente por interacções não covalentes como ligações de hidrogénio, interacções electrostáticas e hidrofóbicas, empilhamento pi ou, no caso da prolina, por efeitos geométricos impostos pelo aminoácido. É importante assim analisar como as caracteristicas dos aminoácidos determinam estas interacções.
Dimensão
Se imaginarmos uma proteína como um puzzle tridimensional, a importância da dimensão dos aminoácidos é imediata. O interior de uma proteína tem uma densidade