T. cruzi
Investigação da existência de vias de sinalização em Trypanosoma cruzi Fábio Lucas
Lívia Souza
Thais Castro
Abordagem
Busca por vias de sinalização em Mus musculus no banco de dados
KEGG.
• Análise de proteínas alvos presentes em 13 vias de sinalização
• Detalhamento de uma via com maior número de proteínas detectadas Abordagem
Busca por similaridade utilizando o programa BLASTp – usando como banco de dados nr(NCBI) restringindo os resultados para a espécie T. cruzi Checagem da existência dos domínios característicos observados em camundongos e no T. cruzi no Pfam.
Verificação do alinhamento da sequencia das proteínas identificadas no CLUSTALW.
Utilização do banco TriTrypDb para maiores informações sobre as proteínas identificadas.
Critérios de Análise
Ex. 1 – Proteína não encontrada
CSL: Alvo de busca na via Notch mmu04330 mmu05169 mmu05203 Notch signaling pathway
Epstein-Barr virus infection
Viral carcinogenesis
E-value muito alto e Max score muito baixo – não existente no organismo de acordo com o critério de análise adotado.
Critérios de Análise
Ex. 2 – Proteína encontrada
Pfam_cruzi
Calmodulin_T.cruzi contém domínio
Pfam_mus
Tritryp_db
Clustalw2
Critérios de Análise
Ex. 3 – Duvidosos
Pfam_cruzi
NOS_T.Cruzi não contém domínio NOS
Pfam_mus
Critérios de Análise
Pfam_cruzi
Ex. 4 – Duvidosos
IP3 3K_T. cruzi contém domínio
Pfam_mus
Tritryp_db
Clustalw2
IP3R_T.Cruzi contêm domínio receptor de IP3
Pfam_cruzi
Ex. 5 – Duvidosos
Pfam_mus
tritrypdb
Ins 145 P3 REC
MiR
RYDR
RYDR
x
RIH assoc.
Ion trans - sim
Resultados e Discussão
Análise das vias de sinalização
Via de Sinalização
Alvos
Notch
PLC
x
NOTCH
x
CI
x
FU /SU (fu)
x
RAF-1
x
HSP-27
x
AKT/PKB
x
VEGFR-2
x
JAK
x
STAT
x
Hedgehog
VEGF
Jak-Stat
m-Tor
Presente