T. cruzi

714 palavras 3 páginas
Bases Moleculares II- Projeto 1

Investigação da existência de vias de sinalização em Trypanosoma cruzi Fábio Lucas
Lívia Souza
Thais Castro

Abordagem
 Busca por vias de sinalização em Mus musculus no banco de dados
KEGG.
• Análise de proteínas alvos presentes em 13 vias de sinalização
• Detalhamento de uma via com maior número de proteínas detectadas Abordagem
 Busca por similaridade utilizando o programa BLASTp – usando como banco de dados nr(NCBI) restringindo os resultados para a espécie T. cruzi  Checagem da existência dos domínios característicos observados em camundongos e no T. cruzi no Pfam.
 Verificação do alinhamento da sequencia das proteínas identificadas no CLUSTALW.
 Utilização do banco TriTrypDb para maiores informações sobre as proteínas identificadas.

Critérios de Análise
Ex. 1 – Proteína não encontrada
CSL: Alvo de busca na via Notch mmu04330 mmu05169 mmu05203 Notch signaling pathway
Epstein-Barr virus infection
Viral carcinogenesis

E-value muito alto e Max score muito baixo – não existente no organismo de acordo com o critério de análise adotado.

Critérios de Análise

Ex. 2 – Proteína encontrada

Pfam_cruzi

Calmodulin_T.cruzi contém domínio

Pfam_mus

Tritryp_db
Clustalw2

Critérios de Análise
Ex. 3 – Duvidosos
Pfam_cruzi
NOS_T.Cruzi não contém domínio NOS

Pfam_mus

Critérios de Análise

Pfam_cruzi

Ex. 4 – Duvidosos
IP3 3K_T. cruzi contém domínio

Pfam_mus

Tritryp_db

Clustalw2

IP3R_T.Cruzi contêm domínio receptor de IP3

Pfam_cruzi

Ex. 5 – Duvidosos

Pfam_mus

tritrypdb

Ins 145 P3 REC

MiR

RYDR

RYDR

x
RIH assoc.

Ion trans - sim

Resultados e Discussão
Análise das vias de sinalização
Via de Sinalização

Alvos

Notch

PLC

x

NOTCH

x

CI

x

FU /SU (fu)

x

RAF-1

x

HSP-27

x

AKT/PKB

x

VEGFR-2

x

JAK

x

STAT

x

Hedgehog
VEGF

Jak-Stat

m-Tor

Presente

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