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Em suas origens, consta como fruto da Proto-História do Ceará, tendo sido fundado por Pero Coelho de Souza, quando de sua malograda Expedição de 1603. No itinerário Paraíba-Ibiapaba e por conveniência de ordem regimental, baixou em acampamento exatamente nessa parte costeira, demorando-se o tempo necessário ao engajamento de tropas indígenas locais. Por ocasião do retorno, miseravelmente abatido e destroçado, acampou no mesmo local, conduzindo apenas dezoito soldados mancos. Desolado, buscou o itinerário que o levaria à Paraíba, onde esperava encontrar apoio. Sem nada conseguir, retornou ao ponto de origem trazendo em sua companhia D. Maria Tomázia, sua mulher e cinco filhos menores. Fundou, então ou denominou o precedente Forte São Lourenço de Forte Nova Lisboa ou Nova Lusitânia. Ao cabo de algum tempo e sem esperanças de apoio, resolveu buscar a Fortaleza dos Reis Magos, onde certamente seria acolhido. Deixou como lembrança histórica, além do Forte, algumas peças de artilharia, nascendo desse desastre o lugar posteriormente crismado de Fortim.
Origem do Topônimo: variação de Fortinho.
Formação Administrativa Distrito criado com a denominação de Canoé, pela lei nº 1271, de 29-05-1934, subordinado ao município de Aracati.
Pela lei nº 386, de 14-10-1937, o distrito de Canoé passou a denominar-se Fortinho.
Em divisões territoriais datadas 31-XII-1936 e 31-XII-1937, o distrito já denominado Fortinho figura no município de Aracati. Pelo decreto estadual nº 448, de 20-12-1938, o distrito de Fortinho passou a denominar-se Fortim.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1960, o distrito já denominado Fortim, permanece no mesmo município de Aracati. Assim permanecendo em divisão territorial datada de 17-I-1991.
Elevado à categoria de município com a denominação de Fortinho, pela lei estadual nº 11928, de 27-03-1992, desmembrado de Aracati. Sede