Modelagem de sistemas de gerenciamento de workflows em redes de petri para sequenciamento de dna

Modelagem de Sistemas de Gerenciamento de Workflows em Redes de Petri para Sequenciamento de DNA
Geise Kelly da Silva Santos, Liliane do Nascimento Vale
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Departamento de Computacao – Universidade Federal de Goi´ s (UFG) ¸˜ a Campus Catal˜ o (CaC) – Catal˜ o – GO – Brazil a a

Abstract. This paper presents the utilization for process of workflow applied in DNA sequencing, and modelled using Petri nets. Firstly, do are shows the concepts of Workflow and Petri Net, their functions too. The biochemistry activities are mentioned, then DNA computing is specified. Therefore, it is instituted an algorithm for to represent the process of sequencing congruous the settings of Petri net. Finally the model is validates through utilizing the software Process Maker, examining the main results obtained. Resumo. Este artigo apresenta a utilizacao de processos de workflow aplicados ¸˜ no sequenciamento de DNA, e modelado usando Rede de Petri. Inicialmente, s˜ o expostos os conceitos de Workflow e Rede de Petri, assim como suas funa cionalidades. Tamb´ m s˜ o descritas as atividades bioqu´micas do DNA, e ent˜ o e a ı a e detalhada a computacao do DNA. Dessa forma, e estabelecido um algoritmo ¸˜ ´ ´ para representar o processo de sequenciamento de acordo com as configuracoes ¸˜ da Rede de Petri. Finalmente, o modelo e validado usando o software Process ´ Maker, discutindo-se os principais resultados obtidos.

1. Introducao ¸˜
´ ` Bioinform´ tica e a ciˆ ncia aplicada a utilizacao de ferramentas e t´ cnicas computacionais a e ¸˜ e ` e fundamentos matem´ ticos para auxiliar na realizacao de atividades comuns a Biologia a ¸˜ Molecular. Seus principais objetivos se resumem em criar, melhorar, desenvolver e manipular banco de dados para a Biologia Molecular, incluindo ferramentas computacionais para coletar, organizar, validar e analisar dados experimentais. ´ Um dos pontos imprescind´veis da Bioinform´ tica e a representacao do sequenciaı a ¸˜ mento de DNA para deteccao de inconsistˆ