diversos
Identificação de microrganismos
Ex. colónia isolada
(amostra clínica, ambiental, alimentar, etc) Bioquímica
Biologia molecular
Fisiologia (ex. ácidos nucleicos, proteínas)
Morfologia
Ecologia
Compilação de propriedades Caracterização do isolado
+)
(
Identificação
TAXONOMIA
(-)
Comparação com propriedades conhecidas de microrganismos
(disponiveis em bases de dados, manuais, etc)
Classificação
Descrição de microrganismo novo*
Nomenclatura
*Espécie nova? - Descrição detalhada; em publicação científica internacional
– Estirpe tipo depositada em colecções de culturas nacionais e/ou internacionais
• Taxonomia
– É a ciência que distribiu os organismos por categorias taxonómicas ou taxa que traduzem o seu grau de semelhança – Divide-se em:
• classificação – define a forma de distribuição dos organismos em grupos taxonómicos (taxa; singular taxon) (com base em semelhança mútua ou relação evolutiva).
• nomenclatura – atribui nomes aos grupos taxonómicos de acordo com regras pré-estabelecidas.
• identificação – é o processo de determinar a que grupo taxonómico pertence um determinado isolado.
Importância da taxonomia
• Permite organizar grandes quantidades de informação • Permite fazer uma previsão das características de um determinado isolado
• A criação de grupos com nomes precisos facilita a comunicação científica
• É essencial para a identificação correcta dos organismos ESPÉCIE - unidade básica da taxonomia microbiana.
• conjunto de estirpes que partilham muitas características estáveis e diferem significativamente de outros grupos de estirpes (é subjectivo);
• conjunto de estirpes com composição G+C (genoma) idêntica, e em que a sequência de nucleotídeos do DNA apresenta ≥ 70% de semelhança.
GÉNERO – grupo bem definido de uma ou mais espécies, claramente separado de outros géneros.
Sistema binominal para a designação da espécie
Shigella flexneri
S.