Bioinformatica

CURSO ON LINE

INTRODUÇÃO À
BIOINFORMÁTICA

Prof. Dr. Francisco Prosdocimi

2007

ÍNDICE
CAPÍTULO 1

CAPÍTULO 2

CAPÍTULO 3

CAPÍTULO 4

CAPÍTULO 5

CAPÍTULO 6

CAPÍTULO 7

CAPÍTULO 8

CAPÍTULO 9

CAPÍTULO 10

UMA VISÃO GLOBAL DA BIOINFORMÁTICA
1.1. O que é a bioinformática?
1.2. O surgimento da bioinformática
1.3. O que preciso saber para ser um bom bioinformata?
1.4. Cursos de pós-graduação em bioinformática no Brasil
1.5. Conversando sobre bioinformática – BIOCHAT
1.6. Referências Bibliográficas e textos complementares
1.7. bRAINsTORM
GENOMA, BIOLOGIA MOLECULAR E COMPUTAÇÃO
2.1. Introdução
2.2. Sequenciamento do DNA
2.3. Genômica
2.4. As ômicas: integrando a bioinformação
2.5. O PERL e outras linguagens de programação
2.6. Referências Bibliográficas e textos complementares
2.7. bRAINsTORM
ALINHAMENTO DE SEQÜÊNCIAS
3.1. Introdução
3.2. Alinhamento Global
3.3. Alinhamento Local
3.4. Alinhamentos ótimos e heurísticos
3.5. Alinhamentos simples e múltiplos
3.6. Matrizes de comparação
3.7. Exemplos reais de alinhamentos
3.8. Referências Bibliográficas
3.9. bRAINsTORM
MONTANDO UM GENOMA
4.1. Sobre genomas eucarióticos e procarióticos
4.2. Base-calling
4.3. Cross-match
4.4. Agrupamento de seqüências
4.5. Sobre a cobertura dos genomas
4.6. Referências Bibliográficas
4.7. bRAINsTORM
ANÁLISE DE TRANSCRIPTOMAS
5.1. As ESTs
5.2. Histórico das ESTs
5.3. Agrupamento de ESTs
5.4. O genoma e o transcriptoma
5.5. SAGE – Serial Analysis of Gene Expression
5.6. Microarrays
5.7. Referências Bibliográficas
5.8. bRAINsTORM
BANCOS DE DADOS EM BIOLOGIA MOLECULAR
6.1. Histórico
6.2. Bancos primários e secundários
6.3. GenBank e GenPept
6.4. RefSeq – O banco de dados de seqüências de referência
6.5. SWISSPROT – O maior banco de dados secundário de seqüências de proteínas
6.6. Gene Ontology – Sistema de classificação de genes de acordo com suas características
6.7. Referências Bibliográficas
6.8. bRAINsTORM