HOMOLOGIA DE PROTEÍNAS COMO FERRAMENT A NA CONSTRUÇÃO DE NOVOS FÁRMACOS

Cenarium Pharmacêutico, Ano 4, n° 4, Maio/Nov 2011, ISSN: 1984-33801

HOMOLOGIA DE PROTEÍNAS COMO FERRAMENTA NA CONSTRUÇÃO DE
NOVOS FÁRMACOS
PROTEIN HOMOLOGY AS A TOOL FOR DEVELOPING NEW DRUGS
Stella Freitas e Dias ¹
Clarice Cunha Taveira ²
Resumo: Na busca pelo desenvolvimento racional de um fármaco, a modelagem por homologia, vem sendo utilizada por indústrias farmacêuticas e em pesquisas para estudos de diferentes compostos que são pensados para interagir com o mesmo alvo, logo, as estruturas podem ser comparadas e os grupos farmacofóricos importantes identificados, permitindo o delineamento de novas estruturas. Também pode ser utilizada para projetar as moléculas que se encaixam e se ligam ao local do receptor ou enzima alvo, ajudar no processo de identificação e otimização de protótipos de candidatos a novos fármacos. A técnica utiliza ferramentas computacionais utilizadas para determinar estruturas 3D de proteínas, baseadas na similaridade entre proteínas homólogas. Consistindo em identificar e selecionar proteínas molde, alinhar as sequências das proteínas, construir o modelo, fazer a otimização do modelo gerado e validá-lo.
Palavras-chave: Modelagem por homologia, receptores, desenvolvimento de fármacos.
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Abstract: When searching for a rational development of a drug, the homology modeling, has been used by the pharmaceutical industry and research to study the binding site, and design molecules that fit and bind to the enzyme target or receptor sites. This technology can also be used to study different compounds that are considered to interact with the same target. The structures can be compared the important pharmacophore groups identified, allowing the design of new structures. It can also be used to design molecules that fit and bind to the receptor site or enzyme target, help the process of identification and optimization of prototypes of new drug