Desvantagens de solftware
A própria Microsoft está incentivando a inconsistência dos softwares dentro do próprio ambiente gráfico: o Ribbon (a mais nova interface adotada pela empresa) apresenta implicações legais que podem impedir sua fácil adoção (referência).
Como o mundo livre oferece mais de um ambiente gráfico, e aplicações são desenvolvidas para tais ambientes, existe o problema de inconsistência da interface e de certas funcionalidades ao se utilizar um aplicativo feito para um ambiente em outro ambiente. Boa parte de tais problemas foi resolvida, e a freedesktop.org tem trabalhado cada vez mais no sentido de permitir tal integração (com bons resultados).
Vale destacar, que um usuário pode obter uma interface muito consistente utilizando apenas um ambiente livre, como o Gnome ou KDE. Ou ainda, trabalhar com aplicativos de diferentes ambientes que apresentem alguma inconsistência (o que não é diferente do mundo proprietário). Quem migrou do Microsoft Office 2003 para o 2007, observe bem essas inconsistências, a exemplo também de quem usa versões server dos sistemas da Microsoft, bem como dos inúmeros antivírus e outros tantos softwares do mercado.
A existência de diferentes ambientes pode ser visto também como algo positivo: permite escolha, opções. O usuário usa a que mais se adequar ao seu interesse.
Uma possível referência.
ERRATA 3:
O Skype É PROPRIETÁRIO, apresentando 11 opções de instalação. Para entender este mundo, é preciso entender de 4 combinações possíveis de softwares:
Software livre, instalado