bioquimica

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A comparação de seqüências de proteínas chamadas chaperones moleculares (descrito no Capítulo 4) auxiliar na processo de enovelamento de proteínas. Uma classe de chaperona encontrada em organismos desde bactérias a mamíferos é proteína de choque térmico 90 (Hsp90). Todos família Hsp90 contêm um ácido "seqüência de assinatura", 10 amino que permite a pronta identificação das proteínas nas bases de dados de sequências. Duas representações de esta sequência de assinatura são mostrados abaixo.
(a) Nesta sequência, os resíduos de aminoácidos que são invariantes (conservada entre todas as espécies)?
(b) em que a posição (ões) de aminoácidos estão limitados a aqueles com cadeias laterais carregadas positivamente? para cada posição, que aminoácido é mais comumente encontrada?
(c) em que as posições são restringidas a substituições de aminoácidos, com o lado de carga negativa correntes? Para cada posição de aminoácido que predomina?
(d) Há uma posição que pode ser qualquer aminoácido, embora de um aminoácido parece ser muito mais frequentemente do que qualquer outro. Que posição é essa, e qual o ácido amino aparece com mais frequência?

resposta
(a), Y (1), C (7) e R (9)
(b) as posições 4 e 9; K (Lys) é mais comum a 4, r (Arg) é invariante às 9
(c) Posições 5 e 10, E (Glu) é mais comum em ambas as posições
(d) A posição 2, S (Ser)

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Bioquímica Protocolos: Seu primeiro Protein Purificação Como o mais novo e menos experiente estudante em um laboratório de pesquisa bioquímica, suas primeiras semanas são gastas lavando copos e rotulagem tubos de ensaio. Você, então, mudar para fazer buffers e soluções de ações para o uso em diversos procedimentos de laboratório.
Por fim, é-lhe dada a responsabilidade para a purificação de uma proteína. É citrato sintase (a enzima do ciclo do ácido cítrico, a ser discutido no Capítulo 16), que está localizado na matriz mitocondrial. Seguido um protocolo para a purificação, continue com os passos