Plano De Pesquisa PET 2014 Raul Da Costa Vieira 1
Programa de Educação Tutorial (P E T) - Q U Í M I C A
PLANO DE ATIVIDADES
Pesquisa
Período:
INÍCIO: Abril/2014 TÉRMINO: Dezembro/2014
01 IDENTIFICAÇÃO DO (A) ORIENTADOR (A)
Nome: Marcos Serrou do Amaral
Curso/Unidade: INFI
Maior titulação: Doutor
Carga horária destinada à orientação: 12 horas
Título do Projeto de Pesquisa do (a) Orientador (a): Simulações Computacionais de Acoplamento Proteína-Ligante
02 IDENTIFICAÇÃO DO (A) ACADÊMICO (A)
Nome: Raul da Costa Vieira
Curso: QUÍMICA (X) BACHARELADO ( ) LICENCIATURA
Título do Plano de Trabalho: Aplicação Computacional voltada para Análise de Dados obtidos por Dinâmica Molecular
03 TIPO DE PLANO DE TRABALHO
(x) Proposta Inicial
( ) Continuidade de PLANO DE TRABALHO anterior (necessário ter apresentado relatório detalhado das atividades desenvolvidas até o momento)
04 RESUMO DO PLANO DE TRABALHO
Neste trabalho, desenvolveremos uma aplicação computacional para analisar resultados obtidos pela técnica de Dinâmica Molecular. A partir dessa análise, obteremos espectros teóricos de absorção ótica de fármaco e/ou de proteína. Esses resultados serão confrontados com dados experimentais.
Palavras-chave: Dinâmica Molecular; Espectro UV/Vis; Modelagem Molecular
05 JUSTIFICATIVA
Muitos dados são gerados quando se trabalha com simulações computacionais. Algumas análises desses dados podem ser realizadas através do uso de ferramentas já disponíveis junto com os pacotes computacionais dos softwares acadêmicos e comerciais. Contudo, diversas análises não estão disponíveis e precisam ser implementadas através do desenvolvimento de aplicações computacionais. Dentre análises importantes, temos a obtenção de espectros teóricos de absorção ótica em compostos químicos e em proteínas. Isso permite compreender melhor os processos envolvidos nas transições eletrônicas dessas substâncias. Além de que, permite-nos propor modelos teóricos para descrição