Pcr em tempo real
Dr Robson Francisco Carvalho rfcarvalho@ibb.unesp.br Departamento de Morfologia
PCR em Tempo Real
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PCR em Tempo Real
O que há de errado com os géis de agarose?
* Pobre precisão * Baixa sensitividade * Curta extensão dinâmica (< 2 logs) * Baixa resolução * Não automatizado
PCR em tempo real
PCR em Tempo Real
O que há de errado com os géis de agarose?
* Resultados não são expressos em números * Colorações não são muito quantitativas * Pós-processamento do produto da PCR * Contaminação (brometo) * Discriminação baseada apenas no tamanho do fragmento
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PCR em Tempo Real
PCR tradicional x PCR tempo real:
Starting Template PCR Round 1 2X Template
Fluorescence
Cycle Análise Real-time PCR tradicional Deteção do produto no gel de agarose Constante detecção e monitoramento dos produtos de amplificação durante toda corrida
PCR Round 2
4X Template
(emissão de fluorescência)
30-40 ciclos
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Sistemas de detecção
PCR em tempo real:
→ Sistema baseado na detecção e quantificação de um sinal fluorescente
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PCR em Tempo Real
Vantagens do PCR em tempo real:
→ Não é influenciado por amplificação não-específica (sondas) → Amplificação pode ser monitorada em tempo real → Ciclos mais rápidos → Detecção de alteração menor que 2x 5x Gel de agarose
PCR em tempo real
PCR em Tempo Real
Vantagens do PCR em tempo real:
→ Maior extensão dinâmica (de até 1010 x) → Requer 1000x menos DNA que demais ensaios (3 picogramas = 1 genoma) → confirmação da amplificação específica (análise da curva de melting) → MAIS ESPECÍFICO, SENSÍVEL e REPRODUZÍVEL → Não é muito mais caro que a PCR convencional (exceção: preço do equipamento)
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PCR em Tempo Real
FASES DA PCR:
→ Exponencial: Dobro do produto é acumulado em cada ciclo (eficiência da reação ~100%). Reação específica e precisa. → Linear: Alta