Em 1853 Independência já figurava como distrito de Crateús na Província do Piauí. Em 1857 foi elevada à categoria de vila, desmembrada de Crateús. Em 1880 é transferida da Província do Piauí para a do Ceará. Em 1892 é extinta a vila de Independência, e em 1896 é recriada. Em 1902, Independência tem seu criado seu primeiro distrito: Novo Oriente, mas, 10 anos antes Independência havia engolido a extinta vila de Vertentes, transformando-a em mero distrito. Em 1931, há muito como município, Independência foi rebaixada a distrito de Crateús. Em 1933, volta a se emancipar, e leva Santa Quitéria como seu distrito (além de Novo Oriente e Vertentes). Em 1937 Bom Princípio se torna mais um distrito de Independência, e 1 ano depois Santa Quitéria muda o nome para Coutinho. Em 1943, o distrito Bom Princípio muda o nome para Ematuba, e o distrito de Vertentes muda o nome para Iapi. Em 1957, Novo Oriente se desmembra de Independência, sendo elevado à categoria de município, e no mesmo ano são criados mais dois distritos: São Francisco e Algodões. Em 1963, O extenso município de Independência emancipa 4 municípios distintos: Coutinho (O distrito de Algodões se transfere para o novo município de Coutinho), São Francisco, Ematuba e Iapi são elevados à categoria de município, sendo que Iapi mudou o nome para Vertentes do Ceará. O município de Independência ficou constituído apenas de distrito-sede. Em 1964, a localidade de Jandrangoeira, se torna distrito. Em 1965, Independência adquire os extintos municípios de Coutinho, Ematuba, São Francisco, e Vertentes do Ceará (que novamente mudou o nome para Iapi). Todos foram rebaixados à categoria de distrito. Em 1988, o distrito de Coutinho muda o nome para Quiterianópolis, e se emancipa, levando para seu território os distritos de Algodões e São Francisco. Em 1992, são criados mais dois distritos em Independência: Tranqueiras e Monte Sinai.
Atualmente Independência possui 6 distritos:
Ematuba
Iapi
Independência (distrito-sede)