GD - Bioquímica
1) Um pesquisador possui uma mistura dos seguintes aminoácidos : Ala , Ser, Phe, Leu, Arg, Asp e His. Sugerir um método que possa ser utilizado para separação desses aminoácidos. Descreva o fundamento do método.
2) O aminoácido lisina possui um grupamento amino adicional e localizado na posição e cujo valor de pKa é 10,5.
a) Qual a carga líquida da Lys em pH=9,5?
b) E em pH=11?
3) Discutir as afirmações abaixo, demonstrando sua veracidade ou falsidade através de evidências que corroboram ou contradizem as informações abaixo:
a) Aminoácidos ácidos apresentam carga liquida negativa em qualquer pH;
b) Uma célula possui centenas de tipos diferentes de aminoácidos
c) Um aminoácido que tenha um grupo ionizável com pKa=6 pode funcionar melhor como tampão em pH=5 do que em pH=7.
4) A hidrólise parcial de uma proteína produz um certo número de polipeptídeos. Um deles foi purificado. Deduza a seqüência de aminoácidos do polipeptídeo através das seguintes informações:
a) a hidrólise ácida total produziu Ala + Arg + 2Ser + Lys + Phe + Met + Try +Pro;
b) o tratamento com fluorodinitrobenzeno (FDNB) seguido por hidrólise ácida total produziu DNF-Ala e -DNF-Lys como únicos DNF-derivados;
c) tanto a carboxipeptidase A quanto a carboxipeptidase B não liberaram o aminoácido C-terminal;
d) o tratamento com brometo de cianogênio produziu dois peptídeos: um contendo Ser + Trp + Pro e o outro contendo os outros aminoácidos (incluindo a segunda serina);
e) o tratamento com quimiotripsina produziu três peptídeos : um contendo somente Ser + Pro, outro contendo somente Met + Try e o terceiro contendo Phe + Lys + Ser + Arg + Ala;
f) o tratamento com tripsina produziu três peptídeos : um contendo somente Ala + Arg, outro contendo Lys + Ser e o terceiro contendo Phe + Try + Met + Ser + Pro.
Informações:
Carboxipeptidase A + B: liberam o resíduo C terminal se este for aromático ou básico.
Carboxipeptidase A: não libera Arg, Lys, Asp,